法律分析：处理软件版权纠纷方式有：
1、调解组织主持下当事人达成和解协议的纠纷解决方式；
2、仲裁机构按照一定的仲裁程序解决当事人纠纷的方式；
3、著作权诉讼是指向人民起诉，利用诉讼程序解决著作权纠纷的一种方式。
根据《中华人民共和国著作权法》规定，由法人或者非法人组织主持，代表法人或者非法人组织意志创作，并由法人或者非法人组织承担责任的作品，法人或者非法人组织视为作者。
法律依据：《中华人民共和国著作权法》
第十一条 著作权属于作者，本法另有规定的除外。
创作作品的自然人是作者。
由法人或者非法人组织主持，代表法人或者非法人组织意志创作，并由法人或者非法人组织承担责任的作品，法人或者非法人组织视为作者。